对临床样本的测序数据进行分析计算,精准分析出样本中已知的真菌物种,获得与之对应的参考序列比对结果,从而鉴定样本中存在的可疑致病真菌物种,用于临床辅助诊断,显著提高医生的工作效率。
对临床样本(比如痰液、肺泡灌洗液、血浆、脑脊液等)中的获得的测序原始数据进行接头、低质量序列过滤,获得高质量序列数据,对获得的高质量测序数据进一步过滤人源核酸序列及重复序列,通过程序软件将收集到的真菌物种构建为数据索引,检索出样本中物种序列,对样本中的真菌物种序列物种鉴定及统计。
| 字段名 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
基因ID |
-- | -- |
分子类型 |
-- | -- |
菌株名 |
-- | -- |
拼接状态 |
-- | -- |
物种名 |
-- | -- |
| fieldName | exampleValue |
|---|---|
| 基因ID | GENOXOR2020300001 |
| 分子类型 | DNA |
| 菌株名 | SD108 |
curl -H "Authorization: Bearer YOUR_API_KEY" \
http://localhost:3001/api/v1/datasets/1187