沙门氏菌是一种常见的人畜共患菌,在人与宠物之间广泛传播。通过接触受污染的食物、环境等导致宠物发病,引发肠炎、败血症等症状。了解猫粪便中沙门氏菌的携带率对于评估公共卫生风险具有重要意义,为疾病预防和控制提供科学依据,保障宠物及人类健康。此外,该研究有助于识别高危群体,制定针对性防控措施,从而降低沙门氏菌病的传播风险,提高整体公共卫生水平。猫粪便沙门氏菌携带率研究还可以为流行病学的研究提供数据支持,有助于确定中国本土区域宠物中沙门氏菌的本底流行水平,为判断后续可能出现的异常流行情况提供基线参照。
1、数据采集:采集猫粪便样本沙门氏菌数据,对样本按照1-503的顺序进行样本编号,并对基础信息、临床资料进行分析调查。2、数据检测:对收集到的503只动物粪便样本分别进行16S微生物测序,按照16S微生物测序数据分析流程进行数据分析,在属水平上统计沙门氏菌检出量%,沙门氏菌检出量%大于0的样本检测结果标记为阳性,等于0 的检测结果标记为阴性。3、数据处理:① 统计阳性总数,平均携带率=阳性总数/样本总数;② 平均携带丰度%=AVERAGE(沙门氏菌检出量%);③ 将沙门氏菌检出量%按照从小到大的顺序排序,Q97.5=97.5%(n + 1)位置(取整数)的检测数值,n为样本总数。4、数据应用:利用PYTHON收集群体样本沙门氏菌检出量%,用MATPLOTLIB将该数据画出拟合图,便于研究人员观察分析。5、数据分类分级:将计算出的沙门氏菌检出量%进行指标评价,分为“高、中、低“不同的类别和级别(沙门氏菌检出量%值大于四分位数Q97.5的为“高”,大于0且小于等于Q97.5为“中”,值为0的为“低”)。
| 字段名 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
序号 |
-- | -- |
取样时间 |
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样品类型 |
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动物类型 |
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沙门氏菌检出量% |
-- | -- |
| fieldName | exampleValue |
|---|---|
| 序号 | 1 |
| 取样时间 | 2023年11月23日 |
| 样品类型 | 粪便 |
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