弯曲杆菌是引起动物胃肠炎的最常见病因之一,可引发宠物的腹泻、呕吐、发热等症状。弯曲杆菌可在人与宠物之间传播,是一种人畜共患菌,严重影响人类健康。了解猫粪便中弯曲杆菌的携带率对于评估公共卫生风险具有重要意义,为疾病预防和控制提供科学依据,保障宠物及人类健康。猫粪便弯曲杆菌携带率研究还可以为流行病学的研究提供数据支持,有助于确定中国本土区域宠物弯曲杆菌的本底流行水平,为判断后续可能出现的异常流行情况提供基线参照。
1、数据采集:从宠物医院收集一批(503只)猫粪便样本,按照1-503的顺序进行样本编号,并对基础信息、临床资料进行分析调查。2、数据检测:对收集到的503只动物粪便样本分别进行16S微生物测序,按照16S微生物测序数据分析流程进行数据分析,在属水平上统计弯曲杆菌检出量%,弯曲杆菌检出量%大于0的样本检测结果标记为阳性,等于0 的检测结果标记为阴性。3、数据处理:① 统计阳性总数,平均携带率=阳性总数/样本总数;② 平均携带丰度%=AVERAGE(弯曲杆菌检出量%);③ 将弯曲杆菌检出量%按照从小到大的顺序排序,四分位数Q3=3 (n + 1)/4位置的检测数值,n为样本总数。4、数据应用:利用PYTHON收集群体样本弯曲杆菌检出量%,用MATPLOTLIB将该数据画出拟合图,便于研究人员观察分析。5、数据分类分级:将计算出的弯曲杆菌菌检出量%进行指标评价,分为“高、中、低“不同的类别和级别(弯曲杆菌检出量%值大于四分位数Q3的为“高”,大于0且小于等于Q3为“中”,值为0的为“低”)。
| 字段名 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
序号 |
-- | -- |
取样时间 |
-- | -- |
样品类型 |
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动物类型 |
-- | -- |
弯曲杆菌检出量% |
-- | -- |
| fieldName | exampleValue |
|---|---|
| 序号 | 1 |
| 取样时间 | 2023年11月23日 |
| 样品类型 | 粪便 |
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