大肠杆菌是动物肠道中常见的细菌,但在某些情况下可能致病。其携带情况是评估猫肠道微生态健康的重要指标之一,大肠杆菌的检测有助于评估猫的肠道健康情况。其次,大肠杆菌不仅影响动物健康,还可能会影响人类,导致人畜共患病。因此,监测宠物猫粪便中的大肠杆菌有助于评估公共卫生风险,并为疾病预防、控制和管理提供关键信息。猫粪便大肠杆菌携带率研究还可以为流行病学的研究提供数据支持,有助于确定中国本土区域宠物中大肠杆菌的本底流行水平,为判断后续可能出现的异常流行情况提供基线参照。
1、数据采集:从宠物医院收集一批(547只)猫粪便样本,按照1-547的顺序进行样本编号,并对基础信息、临床资料进行分析调查。2、数据检测:对收集到的547只动物粪便样本分别进行16S微生物测序,按照16S微生物测序数据分析流程进行数据分析,在属水平上统计大肠杆菌检出量,检测结果大于0的样本标记为检测结果阳性。3、数据处理:① 统计阳性总数,平均携带率=阳性总数/样本总数;② 平均携带丰度=AVERAGE(大肠杆菌检出量%);③ 将大肠杆菌检出量按照从小到大的顺序排序,四分位数Q3=3 (n + 1)/4位置的检测数值,n为样本总数。4、数据应用:利用PYTHON收集群体样本大肠杆菌检出丰度,用MATPLOTLIB将该数据画出拟合图,便于研究人员观察分析。5、数据分类分级:将计算出的大肠杆菌检出量进行指标评价,分为“高、中、低“不同的类别和级别(大肠杆菌检出量值大于四分位数Q3的为“高”,大于0且小于等于Q3为“中”,值为0的为“低”)。
| 字段名 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
序号 |
-- | -- |
取样时间 |
-- | -- |
样品名称 |
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动物类型 |
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大肠杆菌检出量% |
-- | -- |
| fieldName | exampleValue |
|---|---|
| 序号 | 1 |
| 取样时间 | 2023年6月5日 |
| 样品名称 | 粪便 |
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