返回数据集列表
数据集 杭州微数生物科技有限公司

制药、化妆品、食品、环境、临床领域细菌16S 参考序列数据

价格待定
数据描述

制药、化妆品、食品、环境、临床领域发现的微生物经过16S rDNA序列测序后,利用获得的16S rDNA序列通过和本参考数据库序列联配进行细菌种属水平鉴定,以实现污染菌调查、监控、菌种资源的初步筛选,质控菌的确认等目的。

算法/方法论

微数通过查阅细菌合格发表文献、伯杰氏手册从公共数据库筛选合格发表的物种及代表菌株的16S rDNA序列,并通过进化分析、完整度检查(完整度大于70%)和质量检查(兼并碱基小于2%),建立高质量的16S rDNA数据库,并通过第三方训练的数据库进行比较分、阳性样本序列进行数据库的确认,最终建立高质量16S rDNA数据库,N碱基大于等于10比例低至0.7%以下,小于1100bp区域的不完整序列低至2%以下,优于目前的公开数据库。

字段定义
字段名 类型 描述
DMid -- --
分子类型 -- --
拼接状态 -- --
物种名称 -- --
菌株号 -- --
样本数据
fieldName exampleValue
DMid DMSXSWHL0289766
分子类型 DNA
拼接状态 part
调用API获取完整数据
基本信息
数据格式
--
数据类型
--
记录数量
24536
所属行业
科学研究和技术服务业
登记企业
杭州微数生物科技有限公司
V6 评分明细
描述质量 0.0 / 20
结构规范 0.0 / 20
规模时效 0.0 / 15
安全合规 0.0 / 20
认证标注 0.0 / 15
商业价值 0.0 / 10
API 调用示例
curl -H "Authorization: Bearer YOUR_API_KEY" \
  http://localhost:3001/api/v1/datasets/33378
认证信息
证书编号
20240433000001669
登记编号
SZ2024320001669.2