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数据集 探因医学科技(浙江)有限公司

中枢神经系统感染病原微生物分类基因组序列数据

价格待定
数据描述

对脑脊液等中枢神经感染临床样本的测序数据进行分析计算,精准分析出样本中已知的中枢神经感染病原微生物物种,获得与之对应的参考序列比对结果,从而鉴定样本中存在的中枢神经感染病原微生物物种,用于临床辅助诊断,显著提高医生的工作效率。

算法/方法论

对中枢神经感染临床样本中的获得的测序原始数据进行接头、低质量序列、短读长序列、N碱基含量过高等的序列过滤,获得数据进一步以人源基因库为参考基因组过滤掉人源基因及重复序列,通过程序软件建立高质量中枢神经感染病原微生物基因组数据库,将序列与数据库进行比对,获得序列最接近匹配的物种信息以及序列在该物种基因组上的覆盖度等信息,从而实现对脑脊液等中枢神经样本中的物种序列物种鉴定及统计。

字段定义
字段名 类型 描述
基因ID -- --
分子类型 -- --
拼接状态 -- --
物种名 -- --
菌株名 -- --
样本数据
fieldName exampleValue
基因ID GENOXOR2020700001
分子类型 DNA
拼接状态 Contig
调用API获取完整数据
基本信息
数据格式
--
数据类型
--
记录数量
2361
所属行业
科学研究和技术服务业
登记企业
探因医学科技(浙江)有限公司
V6 评分明细
描述质量 0.0 / 20
结构规范 0.0 / 20
规模时效 0.0 / 15
安全合规 0.0 / 20
认证标注 0.0 / 15
商业价值 0.0 / 10
API 调用示例
curl -H "Authorization: Bearer YOUR_API_KEY" \
  http://localhost:3001/api/v1/datasets/4532
认证信息
证书编号
20230933000001556
登记编号
SZ2023120001556.5