乳酸杆菌属是一种革兰氏阳性杆菌,广泛存活于人和动物的肠道,口腔中。乳酸杆菌属是一种重要的肠道有益微生物,可提高营养物质消化吸收,抑制肠道内致病菌,腐败菌增殖,并具有免疫调节作用。乳酸杆菌属可在人与宠物之间广泛传播,影响人类健康。了解犬粪便中乳酸杆菌属的携带率对于评估公共卫生风险具有重要意义,为疾病预防和控制提供科学依据,保障宠物及人类健康。犬粪便乳酸杆菌属携带率研究还可以为流行病学的研究提供数据支持,有助于确定中国本土区域宠物中乳酸杆菌属的本底流行水平,为判断后续可能出现的异常流行情况提供基线参照。关于外部复用价值,对于卫生监管部门,可作为发布官方健康指数,溯源流行病发展,监测环境疾病预防的核心工具,对于医院,可作为疾病诊断的辅助措施,为提供微生态视角的诊断线索。
1、数据采集:从宠物医院收集一批(554只)犬粪便样本,按照1-554的顺序进行样本编号,数据批次为KY1,并对基础信息、临床资料进行分析调查。2、数据检测:对收集到的554只动物粪便样本分别进行16S微生物测序,按照16S微生物测序数据分析流程进行数据分析,在属水平上统计乳酸杆菌属检出量%,乳酸杆菌属检出量%大于0的样本检测结果标记为阳性,等于0 的检测结果标记为阴性。3、数据处理:① 统计阳性总数,平均携带率=阳性总数/样本总数;② 平均携带丰度%=AVERAGE(乳酸杆菌属检出量%);③ 将乳酸杆菌属检出量按照从小到大的顺序排序,四分位数Q3 = 3(n + 1)/4位置的检测数值,n为样本总数。 4、数据应用:利用PYTHON收集群体样本乳酸杆菌属检出量%,用MATPLOTLIB将该数据画出拟合图,便于研究人员观察分析。5、数据分类分级:将计算出的乳酸杆菌属检出量%进行指标评价,分为“高、中、低“不同的类别和级别(乳酸杆菌属检出量%值大于四分位数Q3的为“高”,大于0且小于等于四分位数Q3为“中”,值为0的为“低”)。
| 字段名 | 类型 | 描述 |
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数据批次 |
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编号 |
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取样时间 |
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样品名称 |
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动物类型 |
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| fieldName | exampleValue |
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| 数据批次 | KY1 |
| 编号 | 1 |
| 取样时间 | 2023年11月14日 |
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